Авва Даниил жил в египетской пустыне в Скиту. Трижды на скит нападали варвары-арабы и забирали авву в плен. Дважды, по прошествии нескольких лет в плену, христолюбцы выкупали его. Будучи в плену в третий раз, он, жестоко истязаемый варваром, потерял терпение и камнем убил палача и бежал из плена.
Мучаясь совестью об убийстве, он пошёл в Александрию и исповедал епископу Тимофею случившееся с ним. Получил отпущение греха. Не удовлетворившись этим, он отправился в Рим и там исповедал папе случившееся с ним (в те времена римские епископы были ещё православными). Римский епископ простил его так же, как и Александрийский. Возвратившись, Даниил сказал сам себе: «Я совершил убийство и сам должен быть убит». Он явился в суд и сказал, что поссорившись, увлёкся гневом и ударил своего противника камнем, отчего он умер; поэтому прошу предать меня суду; пусть умру за убийство, чтобы избавиться от наказания в вечности. Авва был посажен в тюрьму, и по истечении 30 дней о нём доложили правителю. Правитель, призвав его из тюрьмы, расспросил его с точностью и в подробностях. Правитель, удивившись рассуждению аввы Даниила, отпустил его, говоря: «Иди авва и моли Бога о мне; жалею, что ты убил одного, а не шесть».
Тогда старец возблагодарил Бога за прощение его, и дал обет Богу: служить во все дни жизни моей прокаженному. И положил в себе: если умрёт этот прокаженный, которого я взял, то пойду в Египет и возьму другого.
Авва Даниил пришёл однажды из пустыни в селение для продажи рукоделия и покупки хлеба. Молодой человек, житель этого селения, упросил его войти в дом свой и сотворить молитву о жене его, которая была бесплодна. Старец Даниил оказал ему послушание, вошёл в дом его и помолился о жене его. По благословению Божию жена его сделалась беременною.
Некоторые, чуждые страха Божия, начали злоречить, говоря: молодой человек не способен к чадорождению! жена его зачала от аввы Даниила. Дошли эти толки и до старца; он послал сказать молодому человеку: когда жена твоя родит, извести меня. Когда жена родила, муж её пришёл в Скит и сказал старцу: Бог, по молитвам твоим, даровал нам дитя. Авва сказал ему: когда будут крестить дитя, сделай в этот день обед и угощение, призови меня, сродников и друзей твоих. Молодой человек сделал так.
Во время обеда, когда все сидели за столом, старец взял дитя на руки и пред всеми спросил его: кто твой отец? Дитя протянуло руку, и показав пальцем на молодого человека, сказало(!): вот отец мой. Ребёнку было 12 дней. Все, видевшие это изумились, прославили Бога, а старец встал из-за стола и бежал в Скит.